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      省人民醫院院檢驗中心建立DNA測序技術平台

      作者: 2014-08-20 09:15:00 來源:浏覽量:

      省人民醫院院檢驗中心建立DNA測序技術平台

       生物的DNA堿基序列蘊藏著全部遺傳信息,破解這些生命天書,對于闡明生命活動秘密至關重要。對生物基因組進行完全測序,是基因組學研究的重要方向,也是生命科學研究的核心領域。過去30,DNA測序技術取得跨越式發展。目前中國醫療領域的基因測序才剛剛起步,與發達國家還有很大差距。基因測序不僅能幫助臨床醫生提高診治水平,而且能爲人群健康監測和疾病預防提供強大支持。爲更好的服務患者、服務臨床、提高我院分子診斷水平,在院部支持下,檢驗中心建立了DNA測序技術平台,将于20148月正式投入使用。此項技術的建立,將爲我院患者的疾病診斷、治療以及普通人群健康狀況的監測提供重要的科學依據,同時,也將爲我院科研水平的提升搭建分子檢測技術平台。現將已開展項目及近期開展項介紹如下:

      一、已開展項目:乙型肝炎病毒耐藥基因突變檢測

      乙型肝炎病毒(HBV)是傳染性疾病乙型病毒性肝炎的主要病因,感染HBV可引起肝硬化和肝細胞癌變。我國是乙型肝炎高發區。據WHO報道,2013年我國乙肝病毒攜帶者1.2億人,慢性乙肝患者超過2000萬人。

      1、臨床意義

      目前臨床上常用的抗HBV藥物爲核苷(酸)類似物,患者需長期維持治療。HBV在宿主體內感染以及抗病毒治療的過程中易發生變異,隨之出現耐藥問題。耐藥突變易引起肝病活動,甚至誘發重症肝炎。而且,突變發生後繼續用藥不僅會增加病人的經濟負擔、造成資源浪費,還可能産生嚴重的流行病學危害。

      乙型肝炎病毒耐藥突變基因檢測,用于慢性乙肝患者抗病毒治療前的藥物選擇和治療中藥效的監測。治療前檢測,可以指導臨床醫生合理選擇抗病毒藥物,不盲目用藥、不過度用藥;治療中每 3-6 個月檢測,可監測治療過程中抗病毒藥物療效,預測疾病進展,爲及時調整治療方案提供理論依據。該項目的開展,有助于臨床醫生分析疾病的個體差異、病情進展趨勢和藥物耐受性,制訂個性化治療方案,提高醫生的乙肝診治水平。

      2、適用科室

       適用于乙型肝炎病毒感染患者的各臨床科室。

      3、標本采集要求

           使用真空幹燥采血管(生化管),采集患者靜脈血3-4mlHBV-DNA熒光定量檢測結果>1x103), 2h內送檢;48h4-8保存。

      4HIS系統提交方式

            乙型肝炎病毒(HBV)耐藥基因突變檢測

      5、送檢地點及聯系方式

       檢測地點:門診七樓檢驗中心分子生物實驗室。

       聯系電話:0931-8281223

      二、近期即將開展項目

      1、腫瘤個體化醫療相關基因檢測

      個體化治療(individualized drug therapy) 是以每個患者的信息爲基礎決定治療方針,從基因組成或表達變化的差異來把握治療效果或毒副作用等應答的個性,對每個患者進行最適宜藥物療法的治療。 通俗的來說,就是考慮個體的差異,對于不同患者,或是同一患者的不同階段,采取最合適的治療方法。

      通過檢測腫瘤患者腫瘤組織中的基因突變靶點及基因SNP分型、mRNA基因定量表達,爲臨床提供靶向及個體化化療的依據,能顯著提高治療的有效率,降低藥物毒副作用。如:20091月美國ASCO消化腫瘤會議總結:選擇K-ras野生基因型患者應用EGFR單抗使美國2008年節約了601億美金,並把這一晚期患者生存期提高了11.5個月。會議達成了一項PJO決議,腸癌患者必須在靶向治療前進行K-ras基因檢測。國際上的相關組織如美國臨床腫瘤學會(ASCO)、美國放射腫瘤學會(ASTRO)和歐洲腫瘤學術機構ESMO,以及中國抗癌協會臨床腫瘤學協作專業委員會(CSCO)等均积极提议:在医院开展预测预报职能的肿瘤個體化治療的检测项目。

      開展腫瘤診療個體化、靶向診療工作,開展預測預報職能的轉化醫學分子病理檢測項目,把基礎研究中某些經循證研究成熟的項目在規範化的醫療系統平台上進行轉化應用,過渡到臨床腫瘤的術前、術後、姑息、支持等各階段的治療方案應用,配合跟進臨床路徑進行檢測。首先針對腫瘤病人的各種個體化/靶向治療需求,用藥前進行臨床預測分析和治療預後評估,根據個體化腫瘤臨床方案和路徑設計檢測項目,深入NCCN癌症综合治疗规范內容体系內,规范检测结果,引导临床路径治疗方案,努力使不同个体基因特征的肿瘤病人治疗获益,减少毒副作用,减少升白、止吐(泻)负担,提高无病生存期和延长生存预后;其次可使晚期癌症患者根据NCCN規範再次得到針對性的個體化/靶向治療,提高生存質量,體現臨終關懷和困難病例檢測救助。更重要的方面是爲不具備基因靶點病人節省費用和毒副作用,減少了患者經濟、心理負擔。檢驗中心將陸續開展以下腫瘤個體化相關基因檢測項目:

      藥物基因組學檢測:

      TSmRNA定量表達與5-FU個體化化療用藥指導;

      lCYP2C19基因分型與用藥指導;

      lCYP2D6藥物基因組學臨床檢測與用藥個體化用藥;

      lCYP3A4基因分型與用藥指導;   

      lDPYD藥物基因組學臨床檢測與氟尿嘧啶類藥物代謝分析;

      lEGFR基因突變檢測預測易瑞沙等TKI類藥物敏感性;

      lUGT1A1基因型及伊立替康用藥指導;

      lERCC1-3藥物基因組學臨床檢測及鉑類用藥   

      lK-RAS藥物基因組學臨床檢測及用藥指導;

      C-kitPDGFR基因檢測突變與格列衛類藥物敏感和耐受的用藥指導。

      癌症診斷:

      lKRAS藥物基因組學臨床檢測與疾病診斷;

      lp53突變與腫瘤基因診斷;

      lHNPCC非息肉性大腸癌基因診斷;

      lFAD多發息肉性大腸APC癌基因診斷;  

      l遺傳性乳腺癌BRCA1基因診斷;

      DCC基因突變與結腸癌診斷。

      2華法林藥物基因組學和個體化用藥相關基因檢測

      華法林是臨床使用最廣泛的口服抗凝藥,其治療窗窄,劑量個體差異大,容易發生出血或栓塞的風險。CYP2C9VKORC1基因多態性明顯影響華法林劑量。其他參與維生素攝入和循環,華法林轉運的基因變異,以及microRNA也可能影響華法林劑量。CYP2C9VKORC1基因多态性检测将为华法林個體化治療提供参考和指导依据。

      3、其他疾病相關基因檢測

      常見非綜合征類耳聾分子篩查: 

      lHFE与血色病的基因診斷;

      lSRY基因與性發育異常分子診斷;

      lAZF基因與少精無精異常分子診斷;

      l進行性肌營養不良DMD缺失突變分子診斷;

      l肝豆狀核變性(WILSON病)分子診斷。

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